ポラリス艦隊とは、アニメ「名探偵コナン」とコラボしたモンスターストライクのオリジナルストーリーの中で登場する宇宙最強の戦闘チームです。彼らはポラリス海賊団との戦いを経て、タイムトラベルで未来の世界に飛ばされました。
そこで彼らを待ち受けていたのは、「轟絶サマ」という強大なモンスター達です。ポラリス艦隊は、新しい力を手に入れるために懸命に戦いますが、サマ達の前にはなすすべもありません。
しかし、そんな時に宇宙から現れたのは、コナンの仲間達でした。彼らはタイムトラベルを駆使し、一緒に未来から戻ってきたのです。コナンたちの協力により、ポラリス艦隊はサマと激しい戦いを繰り広げます。
最後の決戦では、ポラリス艦隊のリーダーである星神がスーパーエボリューションを遂げ、コナンたちもそれに呼応して結集したモンスターたちが勢ぞろいし、サマ達を完全に撃破します。
ポラリス艦隊とコナンたちの共同作戦によって、未来は救われたのでした。このコラボレーションで描かれる未来世界は、まさに夢のような展開ですが、モンストならばあり得る未来です。コナンファンにはたまらない夢のコラボレーションとなることでしょう。
